建設(shè)工程合同糾紛處理流程如下：1,、嚴格招投標和承發(fā)包程序，優(yōu)選施工單位,，嚴格控制工程分包和轉(zhuǎn)包,。
2、建設(shè)前期加強立項管理,，打足投資,，保證歸口使用資金80%以上存入銀行，?？顚Ｓ?。
3、加強合同和信息管理,，簽定協(xié)議盡量采用規(guī)范的合同示范文本,，對附加條款要仔細推敲,，咨詢有關(guān)專家，請專家給予指導(dǎo),。
4,、嚴格進行工程變更把關(guān)，嚴禁通過設(shè)計變更擴大建設(shè)規(guī)模,，增加工程內(nèi)容,，提高建設(shè)標準，對必須變更的,，應(yīng)先做工程量和造價增減分析,。
5、加強隱蔽工程的檢查驗收,，完善隱蔽工程現(xiàn)場簽證手續(xù),。
6、及時解決工程中的索賠問題,。
7,、結(jié)算時，力爭不漏算,，不錯套定額，不亂取費,，并委托具有資質(zhì)的造價咨詢機構(gòu)進行結(jié)算,、委托資深望重的造價工程師主持結(jié)算工作。
8,、進一步規(guī)范業(yè)主,、承包商、政府行政管理部門的行為,，不瞎指揮,。